在正常情况下，食用菌原种、栽培种或栽培袋的污染率在10%以下，操作规范者，污染率只有1%～5%。今天我们谈谈食用菌细菌污染原因是什么，以及食用菌细菌性病害有哪几种，供参考。
液体菌种引起的细菌性污染，大多数情况是以一个发酵罐接种的数量为单位出现，规律性比较明显。固体菌种携带细菌，通常是菌种本身污染，或者受过高温，或者高温运输，或者长期存放的菌种。
灭菌不彻底引起的细菌污染，打开袋子有明显的酸臭味道，一般在接种后的5-7天开始表现出来。一般除了细菌，同时会伴随酵母菌，以及其他的霉菌同时污染。
培养基含水量过大，菌袋在（瓶）的底部有大量的积水，菌丝不能正常的生长，逐渐滋生细菌。
因培养室温度过高，或者摆放的密度过大，导致菌丝在很高的温度生长，细菌在高温环境中开始快速繁殖，表现为细菌污染，这种情况容易出现黄水或者红水。
病原菌为托兰斯假单孢杆菌。杆状，一极或两极有一或多条鞭毛；革兰氏染色阴性。存在于土壤和不洁水中。通过进料、覆土，空气、昆虫及用水传播。
人工种植时，菇床及菇体上也常有此菌，只是在高温、高湿等条件适宜时，繁殖到一定数量，才侵染引起病害。染病后菌盖与菌柄表面呈黑斑，边缘整齐，中间下凹。
防治方法：认真消毒菇房设施，喷l50--250ppm漂白粉。以70℃蒸气消毒覆土。合理用水，发病时减少喷水，将相对湿度降到85%。消灭害虫。注意菇房通风。
病原菌为伞菌假单孢杆菌。形态近似托兰斯假单孢杆菌。高温高湿利于此病发生，蘑菇感病后，开伞前无明显症状，开伞后才见菌褶退色，出现暗褐色区，菌褶表面有含菌的奶油色液滴，最后腐烂变褐。
防治方法：同斑点病的防治。
病原菌为芽孢杆菌。杆状或圆柱状，环境不良时，在细胞内形成1个芽孢，有周生鞭毛或无。革兰氏染色阳性。空气、水、谷粒、覆土、堆肥、昆虫、工具及人均可传播病原菌。
防治方法：在母种培养基内加抗生素（庆大霉素、金霉素、链霉素等）；对谷粒彻底灭菌。接种过程认真无菌操作。
