敌百虫是鱼病防治的常用药物。常见的有晶体敌百虫（含量90%以上）、粉剂敌百虫(2.5%)，还有80%、50%可湿性粉剂敌百虫。由于其中敌百虫的含量不同，其中的辅助成分也不尽相同，使用时区别不同含量按厂家说明书进行使用，不可简单地将有效成分换算使用。一般有效使用期为3年。但敌百虫易吸潮、有挥发性，其水溶液可逐渐分解，在碱性溶液中分解迅速，在酸性溶液中较稳定。应密封保存。
敌百虫主要是防治鱼体寄生虫，对体内外的寄生虫均有驱除效果。采用全池泼洒常用浓度90%晶体敌百虫为粉剂敌百虫浓度为。浸洗鱼种浓度90%晶体敌百虫为，或与面碱（碳酸钠冶用（敌百虫：面碱=l：06），浸洗时间为10-15分钟。可防治指环虫、三代虫、锚头蚤幼虫、鳗居线虫病。用晶体敌百虫，可杀灭水中复殖吸虫的尾蚴，防止双穴吸虫病、血居吸虫病等。用晶体敌百虫与硫酸亚铁合剂(5：2)全池遍洒防治鲢中华鳋病。
对体内寄生虫可将敌百虫拌入饲料中投喂。每100公斤鱼日用药20-30克，制成药饵投喂，每天1次，连续3-6天。可治疗毛细线虫病、棘头虫病。每100公斤鱼日用药6克，每天1次，连续3-6天，可防治九江头槽绦虫。
敌百虫在碱性条件下迅速分解为毒性更强的敌敌畏，一般除与面碱混合增强药效外，不宜与其他碱性强的物质混合使用，同时使用时要注意水中pH值，刚施生石灰后的池塘不宜使用敌百虫。敌百虫忌用金属容器存放或用金属容器溶解药物。一般用塑料瓶装。敌百虫在水溶液中不稳定，配成溶液后不宜久放，应立即泼洒。泼洒时间宜安排在上午进行。由于敌百虫只能杀死锚头蚤幼虫，而不能杀死寄生在鱼体上的成虫，而幼虫常早晨集中于水表层，因此用敌百虫防治锚头鳋宜在早晨用药和多次用药。
敌百虫虽属高效低毒农药，但特种水产品中有些鱼类对其敏感，如鳜鱼、鲈鱼、淡水白鲳、虾类、腹足类等，因而要特别注意。另外因对水中浮游动物有一定杀灭作用，故不宜经常高浓度使用。
