牛蛙及其蝌蚪的敌害很多，如水蜈蚣（龙虱幼虫）、蜻蜓幼虫、野杂鱼（乌鱼、鳜鱼等肉食性鱼类）、龟、鳖、蛙类（特别是虎纹蛙及其蝌蚪）、鸟类等都是蝌蚪的敌害。鼠、蛇等能危害幼蛙和成蛙（包括亲蛙），大蛙也能吞食小蛙，池塘中水绵过多也能将蝌蚪和幼蛙网死。
一只水蜈蚣一昼夜能杀死蝌蚪20-30尾，以体长2-3cm的蝌蚪受害最多，另外，它对幼蛙也有一定的危害。用l-4mg/kg2.5%的敌百虫洒在水面即可杀灭水蜈蚣，对蝌蚪无害。
蜻蜒幼虫对蝌蚪危害相当大，它主要是从腹部将蝌蚪咬死。在池岸喷洒敌敌畏可避免蜻蜒在池内产卵繁殖。
水绵漂浮于水中，蝌蚪或幼蛙游入其中很难脱身，可用硫酸铜(0.7-1.4mg/kg)将它杀灭。
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