苗木从泥土中吸收的水分主要起源于雨水、地下水及灌溉水。在北方干旱地区主要依托灌水弥补泥土中的水分。但如果雨水过多或排水不畅，也会影响苗木的呼吸，严重的会导致烂根甚至死亡。
一、灌溉量和灌溉次数
1、不同栽培方法的灌溉
（l）播种苗播种后要尽量避免表土单调，特别是在北方地区，一些小粒种子播种后覆土较浅，易受春旱的损害。经过合理灌溉使床面维持湿润，避免小苗失水，还可调节地表温度，避免日灼。通常恳求灌水次数多，每次灌水量要少。
（2）扦插、压条、埋条苗这些苗的生根、发芽都需要较大水量，特别是在刚开端展叶而尚未完全生根（即假活期）阶段，叶面蒸腾量较大，泥土水分供给量较少，一旦断水就将造成植株死亡，及时灌水是关键。在北方，气候单调季节更应留意。灌水量可恰当大些，但水流要细、缓，免得水流冲力移动苗木（特别是扦插苗）。
（3）分株苗、移植苗这些苗因为在栽植时根系受伤，苗木内部的水分供给涌现不平衡，必须加强供水。在分株和移植后应延续灌水三四次，灌水量要大些，间隔时间也不能太长。
（4）嫁接苗嫁接苗对水分的需求不是太大，只需能保证砧木的正常生命活动即可。水不能太多，尤其是接口部位不能积水，否则会使伤口糜烂。干旱气象必须灌水时也要留意。
（5）大苗除非在干旱季节才需灌水。如果水分过多，还会使苗木抗性下降，影响生长发育。
2、不同气候条件下的灌溉
灌溉必须依据气候条件的变革机动节制。通常来说，春季到初夏，苗木处于茂盛生长期，南方雨水多，只需灌溉三四次即可。北方是干旱期，要灌七八次。播种苗、扦插苗则需要灌溉次数更多。
初夏，南方是阴雨季节，要留意排水。夏季北方常逢雨季，可不灌水。南方则不同，如果高温又干旱，必须增长灌水次数。秋季，固然南北方雨量不同，但为了让苗木组织充实和木质化，准备越冬，通常不灌水。冬季，南方不灌水，北方则要在土地冰冻前灌一次冻水，以利于苗木越冬。
3、不同泥土条件的灌溉
黏重泥土保水力强，灌水量应恰当减少。砂壤保水力差，灌水量应恰当增长。
4、不同树种的灌溉
不同树种对水的恳求各不相同，幼苗期差别并不太大，通常都需要有足够的水分。随着苗龄的增长，差别越来越显然。对于一些耐旱树种，如臭椿、刺槐、丁香等更应留意，水多时要立刻排水。对于通常树种则要经常维持湿润情况，联结地下水位和降雨情况，判别适宜的灌水量。
二、灌溉方法
1、地面灌溉
高床和垄式作业区，可由灌溉渠把水引入步道或垄沟里，水从侧面渗入床内或垄中。其优点是灌溉后泥土仍具备良好的通气性，能够减少松土的次数，也比较省工，但耗水量太大，苗床宽的会产生灌水不均的景象。
低床或大田式育苗区，可由灌溉渠把水直接引入低床或畦面，水布满床面或畦面而逐步深刻泥土之中，这是漫灌。此法灌水时比较便捷，但应留意水流速度要慢，免得冲倒或沉没苗木。灌溉后泥土易板结，通气不良，要增长松土次数，比较费工。
2、喷灌和滴灌
喷灌通常适用于大苗灌溉，滴灌适用于苗床灌溉，都是比较先进的灌溉方法。
三、排水
降雨或大批灌溉后应及时打消地面积水，苗圃地不应有积水，否则会下降泥土有机质的分解速度，损坏苗木根系的正常呼吸，常引起根系糜烂甚至死亡。
要做好排水工作，首先应平整圃地，其次，建立完善的排水系统，做到外水不浸、内水能排。
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