蜈蚣雌雄异体，卵生。性未成熟的蜈蚣在外形难于区分，性成熟后仔细观察比较，雌雄蜈蚣是有点差异的。一般雌蜈蚣体型较大，头部扁圆、大，呈饼状，第二十一节背板后缘较平而圆，躯体部较宽，腹部肥厚，身体较雄体柔软，用手指轻挤蜈蚣的生殖器鉴别方法，雌蜈蚣无生殖肢。雄蜈蚣体型较小，头部稍隆起，椭圆而小，呈孢子状，第二十一节背板后缘稍隆起，躯干部稍窄，腹部紧缩较瘦。用手指轻挤生殖器，见有1对退化的生殖肢和阴茎。还可观察蜈蚣的活动表现来区分，如雌蜈蚣的活动较少，迟钝，而雄蜈蚣则表现活动频繁，动作灵活。繁殖蜈蚣时，区别外形和观察其活动表现来确定雌雄，对于选种和掌握饲养雌雄比例繁殖是必要的。人工饲养繁殖蜈蚣雌雄搭配以10:1为宜。
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